Секретаријат Министарства обавља послове од заједничког интереса за Министарство који се односе на: финансијска, рачуноводствена, кадровска и административна питања; планирање рада и извештавање о раду Министарства; информисање о раду Министарства; приступ информацијама од јавног значаја; заштиту података о личности; безбедност и заштиту здравља на раду; тајност података; послове одбране; руковање опремом; усклађивање рада унутрашњих јединица; сарадњу са органима државне управе, службама Владе, другим државним органима и Државним правобранилаштвом; и друге послове из делокруга Секретаријата.